Поражаются растения всех возрастов. При заболевании молодых растений на семядолях, нижних листьях и у корневой шейки стебля сначала образуются бурые пятна, а затем на тех же местах появляются язвы или вмятины. В период цветения и созревания льна болезнь развивается на стеблях, веточках и коробочках в виде бурых, неправильной формы, иногда слегка вдавленных, резко ограниченных пятен с темной каймой. Ткани коры на месте пятнистости разрушаются и прилипают к волокну. Часто в местах поражения стебли обламываются. В результате сильного развития заболевания растения трудно убираются, что приводит к большим потерям урожая.